Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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