Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

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Length 1,401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPD2Q15021 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPD2Q15021 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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