Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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