Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE7AQ13946 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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