Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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