Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms