Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD4Q13485 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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