Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXE3Q13461 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXE3Q13461 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXE3Q13461 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXE3Q13461 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXE3Q13461 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXE3Q13461 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXE3Q13461 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXE3Q13461 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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