Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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