Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLAMF1Q13291 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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