Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3FQ13275 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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