Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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