Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME3Q13232 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME3Q13232 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NME3Q13232 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NME3Q13232 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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NME3Q13232 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NME3Q13232 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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NME3Q13232 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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NME3Q13232 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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