Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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