Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
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