Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
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