Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP4Q09028 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms