Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms