Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LTBQ06643 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LTBQ06643 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LTBQ06643 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LTBQ06643 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LTBQ06643 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBQ06643 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBQ06643 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms