Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms