Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPCQ01831 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPCQ01831 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPCQ01831 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPCQ01831 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPCQ01831 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPCQ01831 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPCQ01831 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPCQ01831 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPCQ01831 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPCQ01831 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPCQ01831 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPCQ01831 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
XPCQ01831 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPCQ01831 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPCQ01831 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPCQ01831 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPCQ01831 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPCQ01831 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPCQ01831 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPCQ01831 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPCQ01831 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPCQ01831 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPCQ01831 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPCQ01831 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPCQ01831 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPCQ01831 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPCQ01831 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPCQ01831 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPCQ01831 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPCQ01831 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPCQ01831 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
XPCQ01831 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPCQ01831 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPCQ01831 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPCQ01831 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPCQ01831 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPCQ01831 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPCQ01831 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPCQ01831 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPCQ01831 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPCQ01831 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPCQ01831 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPCQ01831 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPCQ01831 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms