Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms