Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms