Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAT1AQ00266 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAT1AQ00266 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms