Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms