Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK-21P61565 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-21P61565 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms