Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms