Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP6P55212 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP6P55212 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms