Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA1P49639 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA1P49639 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA1P49639 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA1P49639 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA1P49639 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA1P49639 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXA1P49639 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA1P49639 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA1P49639 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA1P49639 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA1P49639 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA1P49639 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA1P49639 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA1P49639 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA1P49639 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA1P49639 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA1P49639 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA1P49639 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA1P49639 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA1P49639 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA1P49639 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA1P49639 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms