Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPOP42166 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPOP42166 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPOP42166 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPOP42166 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPOP42166 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPOP42166 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPOP42166 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPOP42166 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPOP42166 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPOP42166 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPOP42166 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPOP42166 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPOP42166 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPOP42166 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPOP42166 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPOP42166 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPOP42166 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPOP42166 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMPOP42166 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMPOP42166 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TMPOP42166 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMPOP42166 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMPOP42166 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPOP42166 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms