Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER4P35408 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms