Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms