Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
OTX2P32243 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
OTX2P32243 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
OTX2P32243 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OTX2P32243 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OTX2P32243 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms