Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms