Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRABP1P29762 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRABP1P29762 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRABP1P29762 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRABP1P29762 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRABP1P29762 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRABP1P29762 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRABP1P29762 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRABP1P29762 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRABP1P29762 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRABP1P29762 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRABP1P29762 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRABP1P29762 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
CRABP1P29762 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms