Protein–RNA interactions for Protein: P28069

POU1F1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU1F1P28069 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU1F1P28069 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU1F1P28069 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms