Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms