Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSHP23434 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSHP23434 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSHP23434 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSHP23434 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSHP23434 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSHP23434 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSHP23434 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSHP23434 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSHP23434 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSHP23434 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSHP23434 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSHP23434 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSHP23434 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSHP23434 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSHP23434 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSHP23434 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSHP23434 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSHP23434 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSHP23434 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSHP23434 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSHP23434 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSHP23434 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSHP23434 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSHP23434 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSHP23434 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSHP23434 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSHP23434 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSHP23434 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSHP23434 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSHP23434 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSHP23434 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSHP23434 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSHP23434 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSHP23434 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSHP23434 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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GCSHP23434 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSHP23434 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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GCSHP23434 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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GCSHP23434 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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GCSHP23434 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSHP23434 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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GCSHP23434 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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GCSHP23434 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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GCSHP23434 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSHP23434 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSHP23434 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSHP23434 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSHP23434 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSHP23434 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSHP23434 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSHP23434 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSHP23434 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSHP23434 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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