Protein–RNA interactions for Protein: P22303

ACHE, Acetylcholinesterase, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACHEP22303 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACHEP22303 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACHEP22303 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACHEP22303 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACHEP22303 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACHEP22303 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACHEP22303 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACHEP22303 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACHEP22303 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACHEP22303 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms