Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSP20132 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSP20132 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSP20132 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSP20132 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDSP20132 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDSP20132 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDSP20132 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDSP20132 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDSP20132 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDSP20132 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDSP20132 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDSP20132 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SDSP20132 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDSP20132 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SDSP20132 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDSP20132 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDSP20132 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDSP20132 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDSP20132 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDSP20132 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDSP20132 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDSP20132 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDSP20132 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDSP20132 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDSP20132 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDSP20132 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDSP20132 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDSP20132 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDSP20132 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDSP20132 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDSP20132 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDSP20132 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDSP20132 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDSP20132 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SDSP20132 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SDSP20132 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SDSP20132 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SDSP20132 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SDSP20132 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SDSP20132 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDSP20132 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms