Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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