Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms