Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms