Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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DEFA4P12838 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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DEFA4P12838 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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DEFA4P12838 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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DEFA4P12838 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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DEFA4P12838 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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DEFA4P12838 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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DEFA4P12838 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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DEFA4P12838 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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DEFA4P12838 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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