Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms