Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BMP3P12645 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BMP3P12645 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BMP3P12645 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMP3P12645 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMP3P12645 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMP3P12645 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BMP3P12645 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BMP3P12645 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BMP3P12645 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BMP3P12645 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BMP3P12645 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BMP3P12645 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BMP3P12645 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BMP3P12645 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BMP3P12645 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BMP3P12645 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BMP3P12645 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms