Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms