Protein–RNA interactions for Protein: P08174

CD55, Complement decay-accelerating factor, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55P08174 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD55P08174 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD55P08174 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD55P08174 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD55P08174 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD55P08174 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD55P08174 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD55P08174 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD55P08174 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD55P08174 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD55P08174 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD55P08174 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD55P08174 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD55P08174 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD55P08174 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD55P08174 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD55P08174 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD55P08174 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD55P08174 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD55P08174 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD55P08174 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms