Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms