Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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